Il Segretario rappresenta ed esprime l'unità dell'Associazione e ne esercita il coordinamento politico e organizzativo. È eletto dal Consiglio Nazionale a maggioranza qualificata dei suoi componenti e propone allo stesso Consiglio la composizione della Segreteria. La Segreteria individua al proprio interno la figura del Responsabile dell'Organizzazione ed è integrata dalle cariche tecniche (Responsabile alla Comunicazione e, eventualmente, Tesoriere) e dai rappresentanti eletti negli organi consultivi del Ministero. Il Segretario non può svolgere la sua funzione per più di due mandati consecutivi